Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gcc1Q9D4H2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms