Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrp2bpQ9D4C6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms