Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms