Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pramef12Q9D2F1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef12Q9D2F1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms