Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snapc3Q9D2C9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snapc3Q9D2C9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms