Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chordc1Q9D1P4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms