Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms