Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ube2cQ9D1C1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ube2cQ9D1C1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube2cQ9D1C1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube2cQ9D1C1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms