Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ss18l2Q9D174 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms