Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms