Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms