Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gins3Q9CY94 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms