Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2fQ9CY34 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube2fQ9CY34 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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