Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mis12Q9CY25 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mis12Q9CY25 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms