Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Utp23Q9CX11 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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