Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ddx28Q9CWT6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ddx28Q9CWT6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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