Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sycp2Q9CUU3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sycp2Q9CUU3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms