Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rprd1bQ9CSU0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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