Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Atg12Q9CQY1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms