Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifitm3Q9CQW9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ifitm3Q9CQW9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms