Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sar1bQ9CQC9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sar1bQ9CQC9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms