Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CQC3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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