Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkp2Q9CQ73 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkp2Q9CQ73 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms