Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms