Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
StambpQ9CQ26 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
StambpQ9CQ26 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms