Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms