Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ssxb1Q9CPU1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ssxb1Q9CPU1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssxb1Q9CPU1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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