Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lpin3Q99PI4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms