Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GpnmbQ99P91 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms