Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsnaxip1Q99P25 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms