Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms