Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel1Q99MW3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramel1Q99MW3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms