Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd1Q99MV1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms