Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp1b4Q99ME6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms