Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms