Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcf2Q99LE6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms