Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TriobpQ99KW3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms