Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Reep3Q99KK1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms