Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp11Q99K46 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms