Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TrabdQ99JY4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TrabdQ99JY4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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TrabdQ99JY4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TrabdQ99JY4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms