Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psmd6Q99JI4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Psmd6Q99JI4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms