Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Lmo1Q924W9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lmo1Q924W9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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