Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tom1l1Q923U0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tom1l1Q923U0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms