Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf3Q922U1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms