Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms