Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde6cQ91ZQ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Pde6cQ91ZQ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms