Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atpaf2Q91YY4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms