Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1bQ91YK2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1bQ91YK2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms