Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp3Q91W36 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp3Q91W36 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp3Q91W36 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp3Q91W36 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp3Q91W36 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms