Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tdrd3Q91W18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms